在遥远的小学时光，四名游泳部成员在毕业前的比赛中夺得了冠军，然而随着时光流逝，他们各自走上了不同的道路。几年后，七濑遥（岛崎信长 配音）和好友橘真琴（铃木达央 配音）升入岩鸢高中二年级，并与昔日队友叶月渚（代永翼 配音）重逢。三人一起回忆往昔，决定去曾经的游泳馆。然而，在这座废弃的泳池中，他们竟遇到了归国的松冈凛（宫野真守 配音）。 没想到，昔日的队友凛性情大变，甚至对遥发起了挑战，最终遥不敌凛。受此激励，遥、真琴和渚决定重新组建游泳部，经过不懈努力，他们最终招募到新成员龙崎怜（平川大辅 配音）。目标锁定县大赛冠军，队员们开始了紧张的训练。 与此同时，凛所在的鲛柄学院游泳部也在为同一目标奋力拼搏。两支游泳队约定在赛场上一决高下。这个夏天，充满激情和活力的游泳部，开始了属于他们的青春与友情的Free!故事。