故事发生在1999年，那个被称为“世纪之末”的神秘时刻。深山中隐秘的私立学校，因频繁发生灵异事件而被称为“超自然学院”。然而，这所学校迎来了一位全新的校长——神代玛雅（日笠阳子 配音），她年轻、聪明、强势，虽然承载着父亲的遗愿，但她绝对不相信有超自然力量的存在。 玛雅来到这里的真正目的，是调查父亲里奇的死因。她在追寻真相的过程中，遇到了一位神秘男子——内田文明（水岛大宙 配音）。内田的出现，打破了玛雅对现实的认知，因为他宣称自己来自2012年的未来！ 这位穿越时空而来的男子，言辞间透露出的信息让玛雅大为震惊。2012年的世界是什么样子？内田为何要回到1999年？面对内田的神秘言辞和一连串意外事件，玛雅的理性逐渐动摇。她开始相信，或许内田说的并非全是虚构，而一层层隐藏的真相也开始渐渐浮出水面。 随着谜团的解开，玛雅不仅揭示了父亲死因的真相，也发现自己被卷入了一个牵动未来命运的巨大阴谋之中。超自然的力量，跨越时空的因果，这一切与她和内田的命运息息相关……