《无限斯特拉托斯（Infinite Stratos）》的故事设定在一个只有女性能操作的最强兵器“IS”所主宰的世界。在这个女尊男卑的社会中，男主角织斑一夏尽管是男生，却意外成为唯一能够操控IS的男性。因此，他被强制送入培养IS操控者的学校——IS学院。在这里，一夏周围全是女性，同学们对这位“唯一的男性IS操控者”产生了浓厚兴趣。由此，故事展开了一系列充满趣味与挑战的校园生活，充满了竞争、情感波动和幽默的日常。