寄宿着昔日舰艇之魂的少女们，被称为“舰娘”。她们是对抗来自深海的异形敌人“深海栖舰”的唯一希望，为守护人类与大海而不断投入战斗。然而，面对深海栖舰压倒性的数量优势，舰娘们非死即伤，战局逐渐向深海一方倾斜。 此时，驱逐舰“时雨”被编入了一支新的舰队——“第一游击部队 第三部队”（1YB3H）。这支舰队由残存战力临时拼凑而成，包括后方配置的旧式战舰“山城”“扶桑”、唯一的航空巡洋舰“最上”，以及四艘驱逐舰。作为一场战略的核心棋子，她们的任务是执行近乎诱饵的行动，掩护主力部队，为战局的逆转争取希望。 随着战斗愈加激烈，时雨与舰队成员们向命运的海峡进发。在命运与牺牲交织的波涛之中，她们将迎来怎样的结局？一段关于勇气、羁绊与宿命的壮烈篇章，即将上演。