1995年9月，16岁的两仪式与黑桐干也相遇。穿着和服、男孩子气的她并不与任何同学交往，除了黑桐干也，二人之间渐渐产生了某种特殊的联系，开始了平静的校园生活。 然而，城市里突然出现了一连串令人毛骨悚然的猎奇杀人事件。凭借与警察朋友的关系，黑桐得知了一些案件的内幕。他开始怀疑，这一切与两仪式的双重人格有着某种关联。 随着调查的深入，黑桐逐渐发现，两仪式与她的双重人格——两仪织，似乎与这些杀人案件的真相密切相关。随着谜团的层层揭开，两仪家的秘密也在黑桐的面前逐渐暴露。 《空之境界》系列的第二章动画改编自奈须蘑菇的同名小说，继续展开了复杂的命运与心灵的探索。